В 5012 году Землю атаковали инопланетяне и с помощью роботизированной формы жизни практически уничтожили людей. Обосновавшись на Луне, остатки человечества готовятся дать отпор захватчикам — биться во имя человечества предстоит высокотехнологичным воинам-андроидам YoRHa.

Сюжет разворачивается на просторах альтернативной Японии, в постепенно вымирающем городе Сугомори. Главный герой, как часто бывает, - нелюдимый парнишка, которому однажды посчастливилось стать избранным. В чем состоит это счастье? Согласно системе, избранные делятся на команды по восемь человек, они становятся связанными в экспериментальной программе – «кизнайверами». В команде нашего героя народ