Эмия Сиро - молодой маг из Академии Хомурахара в городе Фуюки. Однажды он становится свидетелем борьбы между сверхчеловеческими существами за Святой Грааль - ритуала, когда маги созывают Мастеров и их слуг сражаться друг с другом. Сиро пытается остановить главного злодея, не дать ему выиграть заветный Грааль и спасти невинных людей. Но всё выходит из-под контроля, когда таинственная Тень начинает

Война за Святой Грааль — невероятное сражение, где маги и призванные ими герои прошлого сражаются насмерть за исполнение одного-единственного желания. Положению Сиро Эмии не позавидуешь: в ход Войны вмешивается таинственное существо в маске, а Слуга Сэйбер, его верная соратница, исчезла. Войну можно считать проигранной, но он не может просто сдаться — ведь битва магов подвергает опасности жизни

Война за Святой Грааль в самом разгаре. Сакура Мато, будучи не в силах выдержать собственные грехи, обращается в тень. А Сиро Эмия готов защищать её до последнего. Даже сейчас, когда он знает правду, юноша всё равно собирается идти до конца в своём «правосудии». Вместе с Рин Тосакой он решает закончить войну за Святой Грааль.